Основные задачи Союза:

• объединение граждан, общественных и иных учреждений и организаций для сохранения птиц России и их местообитаний;
• создание национальной стратегии охраны птиц;
• сбор информации о состоянии редких видов птиц и их комплексов, выявление основных факторов, отрицательно влияющих на численность редких видов;
• выявление территорий и акваторий, имеющих важное значение для птиц; содействие организации в таких местах заповедников, заказников и других форм особо охраняемых природных территорий;
• внесение предложений по совершенствованию законодательной базы для охраны птиц и их местообитаний;
• экологическое просвещение населения, распространение и пропаганда знаний о диких птицах России;
• развитие и укрепление международных связей в области охраны птиц и их местообитаний.